数据集概述
本数据集为iwc工作流的测试数据,用于支持Bionano VGP7技术的基因组组装(Scaffolding)流程验证。包含基因组组装所需的输入文件、参数配置文件及Bionano数据文件,共3个文件,覆盖.gfa1、.json、.cmap三种格式。
文件详解
- 输入GFA文件
- 文件名称:
Input GFA.gfa1
- 文件格式:.gfa1
- 字段映射介绍:基因组组装流程的输入GFA格式文件,包含基因组序列的片段及连接信息
- 参数配置文件
- 文件名称:
Estimated genome size - Parameter File.expression.json
- 文件格式:.json
- 字段映射介绍:包含基因组大小估计等参数的配置文件,用于工作流参数设置
- Bionano数据文件
- 文件名称:
Bionano Data.cmap
- 文件格式:.cmap
- 字段映射介绍:Bionano技术生成的基因组图谱数据文件,用于基因组组装的辅助分析
适用场景
- 基因组组装工作流测试: 用于验证iwc工作流在Bionano VGP7基因组组装流程中的运行稳定性与准确性
- 生物信息学工具开发: 作为测试数据支持基因组组装相关工具的开发与优化
- 基因组学研究: 为Bionano VGP7技术在基因组组装中的应用提供数据参考
- 生物信息学教学: 用于基因组组装流程的教学演示与实践操作