数据集概述
该数据集包含小鼠内源性逆转录病毒ETn整合位点相关的基因组区域数据及重组热点特征。具体包括ETn固定区域、对照区域两组区域数据，以及基于1千碱基窗口测量的重组热点含量特征，为研究ETn整合与固定偏好提供数据支持。
文件详解
- 描述文件:
- DESCRIPTION.txt: TXT格式，说明数据集包含的区域数据集和特征内容
- 区域数据文件:
- ETn_fixed.bed: BED格式，包含1296个64千碱基的ETn固定区域数据
- Control.bed: BED格式，包含1142个64千碱基的对照区域数据
- 特征数据文件:
- Recombination_hotspots.txt: TXT格式，包含重组热点含量特征数据
- 表头文件:
- features_header.tabular: TABULAR格式，特征数据的表头信息
- regions_header.tabular: TABULAR格式，区域数据的表头信息
- 压缩文件:
- IWTomics_ETn_dataset_example.zip: ZIP格式，数据集压缩包
数据来源
- R Campos-Sanchez, MA Cremona, A Pini, F Chiaromonte and KD Makova (2016)
- Y Zhang, IA Maksakova, L Gagnier, LN van de Lagemaat, DL Mager (2008)
- H Brunschwig, L Levi, E Ben-David, RW Williams, B Yakir, S Shifman (2012)
适用场景
- 基因组学研究: 分析小鼠内源性逆转录病毒ETn的整合与固定偏好
- 功能数据分析: 研究重组热点与ETn整合位点的关联性
- 生物信息学分析: 探索基因组区域特征与逆转录病毒插入的关系
- 分子遗传学研究: 解析逆转录病毒对基因组结构的影响机制
