数据集概述
本数据集包含Jagodinsky et al 2024研究中,BT处理后第3天采集的肿瘤组织样本的bulk RNA-seq基因表达计数数据。样本来源于高、中、低剂量区域及假手术组,经测序和数据处理后得到基因表达计数矩阵及样本元数据,总计包含2个文件。
文件详解
- 文件名称:bulk_RNA-seq.sample_meta.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:预计包含样本元数据信息,如样本编号、处理剂量组(高/中/低剂量、假手术组)、采样区域等(具体字段基于研究设计,未提供详细预览)。
- 文件名称:bulk_RNA-seq.gene_counts.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含基因表达计数矩阵,主要字段有gene_id(基因ID)、Symbol(基因符号),以及各样本(如BT1、BT10、Sham1等)的基因表达计数数值。
数据来源
Jagodinsky et al 2024研究
适用场景
- 肿瘤基因表达差异分析: 比较BT处理不同剂量组与假手术组肿瘤组织的基因表达谱差异,筛选关键差异表达基因。
- 肿瘤治疗响应机制研究: 分析高、中、低剂量BT处理后肿瘤组织的基因表达变化,探究治疗响应的分子机制。
- 生物标志物筛选: 基于基因表达数据,筛选与BT治疗效果相关的潜在生物标志物。
- 肿瘤生物学功能注释: 对差异表达基因进行功能富集分析,揭示BT处理影响的生物学通路和功能模块。