数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了JC55品系flr-1(ut11)X基因线虫的行为实验数据。实验在特定培养条件下进行,使用tierpsy软件追踪线虫运动,包含视频处理后的骨架数据、特征数据及标准化格式文件,用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 行为数据文件
- 文件名称:flr-1 (ut11) on food L_2010_03_31__11_57_23__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始追踪数据,可能涉及运动轨迹、时间序列等基础行为记录
- 特征数据文件
- 文件名称:flr-1 (ut11) on food L_2010_03_31__11_57_23__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于19371个分段骨架计算,可能涉及运动速度、身体弯曲度等特征指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:flr-1 (ut11) on food L_2010_03_31__11_57_23__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:采用标准化的蠕虫行为数据格式(wcon),便于跨平台的行为数据共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析flr-1(ut11)X基因突变体的行为表型,探究该基因在行为调控中的作用
- 神经生物学研究: 基于线虫运动轨迹和特征数据,研究神经系统对行为的调控机制
- 药物筛选辅助: 对比野生型与突变体线虫的行为差异,为相关药物的筛选提供行为学参考
- 行为分析算法验证: 利用标准化的行为数据,验证或优化线虫行为追踪与特征提取算法