数据集概述
本数据集围绕放线菌中抗生素抗性基因（erm、ABC转运蛋白基因）与16S rRNA基因的系统发育相关性展开，包含90株分离自不同土壤环境的放线菌菌株实验数据，以及JGI_IMG数据库中246株含ABC转运蛋白基因、31株含erm基因菌株的生物信息学分析数据，用于探究抗性基因进化与土壤环境的关联。
文件详解
- 文件名称：Fig_1.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含研究中与erm基因序列距离和16S rRNA基因系统发育距离相关性相关的图表数据
- 文件名称：Fig_2.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含研究中ABC转运蛋白基因序列距离和16S rRNA基因系统发育距离相关性相关的图表数据
- 文件名称：Fig_3.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含研究中菌株系统发育距离与土壤pH、有机质含量相关性相关的图表数据
- 文件名称：Fig_4.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含研究中JGI_IMG数据库菌株抗性基因系统发育与16S rRNA/管家基因相关性相关的图表数据
数据来源
Integrated Microbial Genomes (JGI_IMG) database、土壤分离放线菌菌株实验数据
适用场景
- 微生物抗性基因进化研究: 分析erm、ABC转运蛋白等抗性基因与16S rRNA基因的系统发育关联，探究抗性基因的进化规律
- 土壤环境微生物生态学研究: 研究土壤pH、有机质含量等环境因子对放线菌菌株系统发育及抗性基因分布的影响
- 微生物数据库数据分析: 利用JGI_IMG数据库数据，开展抗性基因与菌株系统发育相关性的生物信息学分析
- 抗生素生产菌筛选研究: 基于抗性基因与系统发育的关联，为新型抗生素生产菌的筛选提供理论参考
