数据集概述
本数据集围绕假单胞菌噬菌体抗性相关的单核苷酸变异（SNPs）展开，包含噬菌体抗性变异株的SNPs识别结果、细菌生长与竞争实验数据、植物体内适应性分析数据、噬菌体吸附实验数据，以及配套分析代码和可视化结果，为研究单核苷酸变异对细菌噬菌体抗性的影响提供支持。
文件详解
- 单核苷酸变异（SNPs）识别文件：
- C2_SNP.csv、C4_SNP.csv、C17_SNP.csv、C18_SNP.csv：CSV格式，记录各噬菌体抗性变异株（C2、C4、C17、C18）中识别出的SNPs信息，字段包括CHROM（染色体）、POS（位置）、TYPE（变异类型）、REF（参考碱基）、ALT（变异碱基）、EFFECT（变异效应）等。
- 实验数据文件（Excel格式）：
- Bacterial_growth.xlsx：细菌生长分析的原始及预处理数据
- Competition assays.xlsx：竞争实验的原始及预处理数据
- Plant experiment.xlsx：植物体内适应性实验的原始及预处理数据
- phage adsorption assays.xlsx：噬菌体吸附实验的原始数据
- 分析代码文件：
- Code_Vacheron.html：数据分析所用代码
- Phage_JV_drop.Rmd：处理和分析细菌空间分布数据的R代码
- 空间分布数据压缩包：
- drop_competitions.rar：包含bmp格式的菌落图像（GFP和红色通道）及相关分析代码，记录体外竞争实验中细菌的空间分布情况
适用场景
- 微生物遗传学研究：分析单核苷酸变异对假单胞菌噬菌体抗性的分子机制
- 细菌生态学研究：探究细菌在体外竞争及植物体内环境中的适应性与空间分布特征
- 噬菌体-细菌互作研究：通过吸附实验数据解析噬菌体抗性的表型机制
- 实验数据复现与验证：利用配套代码复现细菌生长、竞争等实验的数据分析过程
