加利福尼亚白橡树物种群落的进化与种群历史综合研究数据

数据集概述

本数据集围绕加州灌丛白栎物种复合体(栎属)的进化与种群历史展开,包含遗传分化模式分析、物种分化场景模拟、分布模型及生态位分化测试等相关数据,用于探究地理隔离与生态分化在物种形成中的作用,共9个文件。

文件详解

  • 系统发育树数据
  • 文件名称:PhylogeneticTrees.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含用于分析物种进化关系的系统发育树相关文件
  • 基因型数据
  • 文件名称:GenotypicData.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:记录物种复合体的基因型信息,支持遗传分化分析
  • Mantel检验输入文件
  • 文件名称:MantelTestInputFiles.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:用于遗传分化与生态位重叠相关性检验的输入数据
  • 分布点数据
  • 文件名称:OcurrenceData.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含物种分布点信息,用于物种分布模型构建
  • Maxent气候图层数据
  • 文件名称:MaxentClimateLayers.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:提供Maxent模型所需的气候图层数据,支持生态位分析
  • PCA输入文件
  • 文件名称:PCAInputFiles.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:用于主成分分析的输入数据,辅助遗传结构解析
  • 种群分析输入文件
  • 文件名称:PopulationsInputFiles.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:种群遗传分析相关的输入数据
  • Structure输入文件
  • 文件名称:StructureInputFiles.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:用于种群遗传结构分析工具Structure的输入数据
  • BAPS输入文件
  • 文件名称:BAPSInput.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含用于BAPS软件分析的结构化数据,示例内容为多组数值序列(如“80 13 75 95 24 1”等)

数据来源

论文“Evolutionary and demographic history of the Californian scrub white oak species complex: an integrative approach”

适用场景

  • 物种形成机制研究:分析地理隔离与生态分化在加州灌丛白栎物种复合体形成中的作用
  • 进化关系解析:利用系统发育树数据探究物种复合体的进化历史
  • 种群遗传结构分析:通过基因型数据与Structure、BAPS输入文件,解析种群遗传分化模式
  • 物种分布模型构建:结合分布点数据与气候图层,模拟物种当前及历史分布
  • 生态位分化测试:通过生态位分析数据检验物种间的生态位分化程度
  • 遗传与环境相关性分析:利用Mantel检验输入文件,探究遗传分化与环境因子的关联
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 36.85 MiB
最后更新 2026年1月31日
创建于 2026年1月31日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。