数据集概述
本数据集围绕加州灌丛白栎物种复合体(栎属)的进化与种群历史展开,包含遗传分化模式分析、物种分化场景模拟、分布模型及生态位分化测试等相关数据,用于探究地理隔离与生态分化在物种形成中的作用,共9个文件。
文件详解
- 系统发育树数据
- 文件名称:PhylogeneticTrees.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含用于分析物种进化关系的系统发育树相关文件
- 基因型数据
- 文件名称:GenotypicData.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录物种复合体的基因型信息,支持遗传分化分析
- Mantel检验输入文件
- 文件名称:MantelTestInputFiles.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:用于遗传分化与生态位重叠相关性检验的输入数据
- 分布点数据
- 文件名称:OcurrenceData.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含物种分布点信息,用于物种分布模型构建
- Maxent气候图层数据
- 文件名称:MaxentClimateLayers.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:提供Maxent模型所需的气候图层数据,支持生态位分析
- PCA输入文件
- 文件名称:PCAInputFiles.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:用于主成分分析的输入数据,辅助遗传结构解析
- 种群分析输入文件
- 文件名称:PopulationsInputFiles.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:种群遗传分析相关的输入数据
- Structure输入文件
- 文件名称:StructureInputFiles.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:用于种群遗传结构分析工具Structure的输入数据
- BAPS输入文件
- 文件名称:BAPSInput.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含用于BAPS软件分析的结构化数据,示例内容为多组数值序列(如“80 13 75 95 24 1”等)
数据来源
论文“Evolutionary and demographic history of the Californian scrub white oak species complex: an integrative approach”
适用场景
- 物种形成机制研究:分析地理隔离与生态分化在加州灌丛白栎物种复合体形成中的作用
- 进化关系解析:利用系统发育树数据探究物种复合体的进化历史
- 种群遗传结构分析:通过基因型数据与Structure、BAPS输入文件,解析种群遗传分化模式
- 物种分布模型构建:结合分布点数据与气候图层,模拟物种当前及历史分布
- 生态位分化测试:通过生态位分析数据检验物种间的生态位分化程度
- 遗传与环境相关性分析:利用Mantel检验输入文件,探究遗传分化与环境因子的关联