数据集概述
本数据集包含支持加拿大安大略省北黄轴扑翅䴕体内新种等孢球虫(Isospora picoflavae)命名的形态与分子数据,涵盖线粒体基因组注释、序列比对、系统发育分析结果等补充资料,共16个文件,分属4个目录。
文件详解
该数据集按研究内容分为3类目录,具体文件说明如下:
- 等孢球虫线粒体基因组注释补充数据目录(Supplementary Data - Annotated mitochondrial genome of Isospora picoflavae/):
- Supplementary Data Figure 1 - Annotated mt genome of Isospora picoflavae-pfrNtE.pdf:PDF格式,等孢球虫线粒体基因组注释图
- Supplementary Data Table 1 - Primers for mt genome and nu 18S rDNA.pdf:PDF格式,线粒体基因组与核18S rDNA引物表
- Supplementary Data Table 2 - mt genome annotations.csv:CSV格式,线粒体基因组注释信息表,含特征名称、长度、方向等字段
- 线粒体基因组比对与贝叶斯分析补充数据目录(Supplementary Data - Figure 3 - Whole mitochondrial genome alignment and Bayesian Analysis/):
- Supplementary Data - GenBank Accession numbers for complete mt genomes.docx:DOCX格式,完整线粒体基因组GenBank登录号
- Whole mt genome alignment-QnjlxB.geneious:Geneious格式,全线粒体基因组比对数据
- Whole mt genome alignment.fasta:FASTA格式,全线粒体基因组比对序列
- Whole mt Genome Alignment.nex:NEXUS格式,MrBayes分析命令块
- Figure 3 - Rejman et al. - Isospora picoflavae n. sp. - complete mt genome sequences - BI tree.pdf:PDF格式,线粒体基因组贝叶斯系统发育树
- Whole mt genome Bayesian Posterior Output-vn8ADd.geneious:Geneious格式,MrBayes后验输出结果
- 核18S rDNA与线粒体COI序列串联分析补充数据目录(Supplementary Data - Figure 4 - Concatenated nuclear 18S rDNA_partial mitochondrial COI sequence alignment and Bayesian Analysis/):
- Supplementary Data - Concat nu 18S rDNA and partial mt COI - Taxa and GenBank Accession Numbers-OQjpEr.docx:DOCX格式,串联序列分类群及GenBank登录号
- Supplementary Data - Nuclear 18S rDNA of Isospora picoflavae with primers mapped-BVWNl6.pdf:PDF格式,带引物标记的核18S rDNA序列图
- Supplementary Data - Figure 4 - Concat nu rDNA and partial mt COI Alignment-GzSLcn.fasta:FASTA格式,串联序列比对文件
- Supplementary Data Figure 4 - MrBayes Block-6vliBI.nex:NEXUS格式,MrBayes分析命令块
- Supplementary Data - Figure 4 - Concat nu rDNA and partial mt COI Alignment-BQkHQD.geneious:Geneious格式,串联序列比对数据
- Supplementary Data - Figure 4 - MrBayes Posterior Output-Fp8w35.geneious:Geneious格式,MrBayes后验输出结果
- Supplementary Data Figure 4 - Concat nu rDNA plus partial mt COI - MrBayes tree.pdf:PDF格式,串联序列贝叶斯系统发育树
适用场景
- 寄生虫学研究:用于等孢球虫新种的分类鉴定与系统发育分析
- 分子生物学研究:支持线粒体基因组注释、基因序列比对及进化分析
- 生物信息学分析:可作为MrBayes等系统发育分析工具的实操案例数据
- 野生动物寄生虫监测:为北黄轴扑翅䴕体内寄生虫多样性研究提供基础数据