数据集概述
本数据集是用于测试Liston Lab简化流式细胞术脚本(Simplified FlowCytoScript)分析工具的示例数据,包含野生型(WT)与敲除型(KO)样本的血液及肠道相关淋巴组织(GALT)的流式细胞术数据,以FCS原始数据和CSV格式文件呈现。
文件详解
该数据集包含8个文件,存储于AuroraData目录下,具体说明如下:
- 流式细胞术原始数据文件(.fcs格式):
- WT_Blood_ALSJ8.3_002_CD8_WT (CD45.1).fcs:野生型血液样本CD8+ T细胞流式数据
- GALT_WT_IEL_ALSJ8.3_002_CD8_WT (CD45.1).fcs:野生型肠道相关淋巴组织上皮内淋巴细胞流式数据
- GALT_KO_IEL_ALSJ8.3_002_CD8_KLRG1 (CD45.2).fcs:敲除型肠道相关淋巴组织上皮内淋巴细胞流式数据
- KO_Blood_ALSJ8.3_002_CD8_KLRG1 (CD45.2).fcs:敲除型血液样本CD8+ T细胞流式数据
- 数据分析结果文件(.csv格式):
- 与上述4个FCS文件一一对应的CSV文件,如WT_Blood_ALSJ8.3_002_CD8_WT (CD45.1).csv
- 字段示例:FSC-A(前向散射面积)、SSC-A(侧向散射面积)、CD45.1(细胞表面标志物)、CD8(细胞表面标志物)、KLRG1(细胞表面标志物)等
适用场景
- 流式细胞术数据分析工具测试:验证Liston Lab简化流式细胞术脚本工具的功能与性能
- 免疫细胞表型分析:研究野生型与敲除型样本中CD8+ T细胞的表面标志物表达差异
- 组织特异性免疫细胞研究:比较血液与肠道相关淋巴组织中免疫细胞的分布与特征
- 生物信息学方法开发:用于流式细胞术数据处理算法的开发与优化