胶质瘤甲基化性别差异HOMER基序分析数据集

数据集概述

该数据集包含胶质瘤甲基化性别特异性差异的HOMER基序分析输入数据与结果,涉及胶质母细胞瘤(GBM)及非GBM的IDH突变亚型,通过结构化目录存储不同性别分组的基序分析文件,为研究胶质瘤甲基化性别差异的分子机制提供数据支持。

文件详解

该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 目录结构: - SexDiffGliomaMethylation/:主目录 - Homer Input Files/:包含输入数据文件,如IDHmutcodel_M_to_Fa.txt(探针位置等信息) - Homer Result/:包含不同亚型和性别分组的分析结果,如GBM_HyperFemales_MotifOutput、GBM_HyperMales_MotifOutput等 - 文件类型与内容: - .info.html文件:位于homerResults/目录下,如motif10.info.html,提供基序信息的网页文档 - .motif文件:占比约百分之四十一,为主要数据文件类型 - .svg文件:占比约百分之三十,可能为可视化结果图 - .tsv文件:如seq.autonorm.tsv,包含寡核苷酸的标准化计数数据,字段有Oligo、TargetCounts、BackgroundCounts、NormalizationFactor等 - .txt文件:如IDHmutcodel_M_to_Fa.txt,包含探针的染色体位置等信息

适用场景

  • 胶质瘤分子机制研究:分析甲基化性别差异相关的基序特征
  • 生物信息学分析:验证HOMER基序分析在肿瘤性别差异研究中的应用
  • 肿瘤精准医学研究:探索胶质瘤性别特异性的分子标志物
  • 表观遗传学研究:探究甲基化修饰在胶质瘤性别差异中的作用机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.15 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
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