数据集概述
该数据集聚焦家燕(Hirundo rustica)近缘种群的基因组分化研究,结合基因型与表型数据,探究选择与地理隔离对种群分化的相对贡献。数据涵盖8个种群350个样本的9493个单核苷酸多态性(SNPs)及迁徙行为、性信号等表型指标,为解析隔离适应(IBA)与隔离距离(IBD)机制提供支持。
文件详解
- 文件名称: rfseq_protocol.pdf
- 文件格式: PDF
- 内容说明: 可能包含简化基因组测序(RAD-seq)实验的技术方案文档
- 文件名称: pairwise differences - genotype and phenotype.txt
- 文件格式: TXT
- 字段示例: pop.1(种群1)、pop.2(种群2)、avg.fst(平均Fst值)、median.fst(中位数Fst值)、wing.length.delta.P(翅长差异P值)、abs.diff.wing(翅长绝对差异)、tail.length.deltaP(尾长差异P值)、abs.diff.tail(尾长绝对差异)、euc.dist(地理欧氏距离)等
- 文件名称: h_rustica_GBS_gprobs.txt
- 文件格式: TXT
- 内容说明: 可能包含家燕基因型概率数据文件
- 文件名称: parse_barcodes768.pl
- 文件格式: PL(Perl脚本)
- 内容说明: 用于解析768个样本条形码的Perl脚本文件
适用场景
- 进化生物学研究: 分析近缘种群基因组分化的驱动因素(选择 vs 地理隔离)
- 种群遗传学分析: 探究隔离适应(IBA)与隔离距离(IBD)的相对贡献
- 行为生态学研究: 解析迁徙行为、性信号表型与基因组分化的关联机制
- 生物信息学应用: 利用基因型概率数据开展种群遗传结构分析
- 实验方法参考: 作为简化基因组测序实验方案的技术文档资源