芥菜型油菜A亚基因组与其他含A亚基因组芸薹属物种共线性及分化数据集

数据集概述

本数据集围绕芥菜型油菜(B. juncea)A亚基因组(Aj)与其他含A亚基因组芸薹属物种(白菜B. rapa、甘蓝型油菜B. napus)的结构分化展开,包含遗传连锁图谱构建、亚基因组比较分析及群体遗传分析的相关数据,为研究芸薹属A亚基因组进化提供支持。

文件详解

  • 数据文件(.xlsx格式):
  • Information of DArT-SeqTM markers and genotypes of the 26 diverse lines from the three A genome-carrying species.xlsx:包含DArT-seq标记信息及26份含A亚基因组物种材料的基因型数据
  • Fig4B markers.xlsx:图4B相关的标记数据
  • Fig 4A markers.xlsx:图4A相关的标记数据
  • Genotype that used for Additional file 6.xlsx:补充文件6所用的基因型数据
  • 文档文件(.pdf格式):
  • Additional File 5 Phylogenetic tree of the three A genome-contained species evaluated with different sets of markers.pdf:补充文件5,含不同标记集构建的三个含A亚基因组物种系统发育树
  • Fig. 4 Phylogenetic tree of the three A genome contained species B. rapa, B. juncea and B. napus.pdf:图4,白菜、芥菜型油菜、甘蓝型油菜的系统发育树

适用场景

  • 芸薹属植物基因组进化研究:分析不同A亚基因组的共线性与结构变异
  • 芥菜型油菜遗传图谱应用:基于高密度遗传连锁图谱开展性状定位研究
  • 物种亲缘关系分析:利用群体遗传数据探究含A亚基因组芸薹属物种的分化
  • 分子标记辅助育种:参考DArT-seq标记信息开发油菜育种分子标记
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 91.71 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。