结构感知后翻译修饰预测数据集_SAPP

数据集概述

该数据集为结构感知后翻译修饰(PTM)预测(SAPP)相关研究的训练、测试数据及结果文件集合,涵盖磷酸化、乙酰化等多种PTM类型数据及相对溶剂可及性(RSA)特征文件,支持PTM预测模型开发与评估。

文件详解

该数据集包含两个核心目录,具体说明如下: - Datasets/ 目录: - SAPPphos: 包含丝氨酸/苏氨酸(S/T)磷酸化的训练和测试数据集 - Kinase-specific: 包含针对激酶组特异性磷酸化的训练和测试数据集 - otherPTM: 包含其他类型后翻译修饰(如乙酰化、甲基化、类泛素化、泛素化)的训练和测试数据集 - RSA_files: 包含所有用于训练和推理的蛋白质序列的预计算相对溶剂可及性(RSA)文件 - Results/ 目录: - Kinase: 激酶特异性PTM预测模型的预测和评估结果 - otherPTM: 其他PTM类型预测模型的预测和评估结果 - RSAresult: 包含与RSA特征相关的消融研究结果 - 其他文件:用于生成主手稿和补充材料中的图表和表格

适用场景

  • 生物信息学模型开发: 用于训练和测试结构感知的后翻译修饰预测模型
  • 激酶特异性研究: 支持激酶组特异性磷酸化预测模型的构建与评估
  • 多类型PTM分析: 适用于乙酰化、甲基化等多种后翻译修饰的预测研究
  • 蛋白质结构特征分析: 可结合RSA特征开展后翻译修饰预测的消融实验与特征重要性分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 174.31 MiB
最后更新 2025年12月13日
创建于 2025年12月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。