数据集概述
本数据集记录了金头鲷(Sparus aurata)感染石斑扁形虫(Sparicotyle chrysophrii)后鳃糖基化的变化。通过液相色谱质谱分析糖基化数据,并关联糖基转移酶表达、寄生虫数量、鳃微生物群中2013Ark19i细菌丰度及鳃组织中嗜酸性粒细胞和杯状细胞数量,为理解该疾病及相关问题提供数据支持。
文件详解
- Excel数据文件:
- Fish data.xlsx:记录个体寄生虫丰度、体重、杯状细胞与嗜酸性粒细胞定量数据,以及鳃微生物群中2013Ark19i细菌的丰度百分比。
- Supplementary File 1_Glycan quantification.xlsx:包含所有已鉴定糖链结构的个体定量值。
- Transferase data.xlsx:记录金头鲷基因组中132种糖基化相关酶的个体表达水平。
- PDF文档:
- Supplementary File 2-Differentially expressed transcripts related toglycosylation.pdf:展示差异表达转录本(P < 0.05)的柱状图。
- PZFX统计文件:
- Transcripts statistics.pzfx:差异表达转录本的统计分析结果。
- Correlations.pzfx:糖组结构与寄生虫、微生物群、嗜酸性粒细胞或杯状细胞丰度的相关性分析结果。
- Stats on core and terminal structures.pzfx:核心与末端糖链结构的统计分析结果。
- Stats on individual O and N glycans.pzfx:对照组与感染组鱼之间O-糖链和N-糖链相对丰度比较的统计分析结果。
适用场景
- 鱼类寄生虫病研究:分析糖基化变化与石斑扁形虫感染的关联机制。
- 糖生物学研究:探究鱼类鳃组织糖基化修饰在免疫反应中的作用。
- 微生物-宿主相互作用研究:分析鳃微生物群与寄生虫感染及宿主免疫指标的关系。
- 水产养殖疾病防控:为金头鲷养殖中寄生虫病的诊断与防治提供数据参考。