数据集概述
本数据集为“机器引导的细胞命运工程”研究生成,包含首轮转录因子库(TFome)筛选的流式细胞术数据、测序细胞终末群体数据,以及诱导肝细胞(iHeps)、星形胶质细胞(iAsts)、细胞毒性T细胞(iCytoTs)和调节性T细胞(iTregs)的功能测试数据,RNA测序数据将在NCBI GEO发布。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件,具体说明如下:
- 流式细胞术数据文件(位于不同子目录下):
- 格式:.fcs、.csv、.png、.r
- 示例文件:
- cytometry_results_5_CT_media_diff.csv:CSV格式,包含Line、Type、Population、Markers、Label、Percent等字段,记录流式细胞术检测结果
- Ast_BPhys_Data Source - 1.fcs:FCS格式,星形胶质细胞流式细胞术数据
- Hepatocytes_ASGPR1_CD184.png:PNG格式,肝细胞标志物检测结果图
- make_plots.R:R语言脚本,用于生成可视化图表
- 功能表征数据文件(位于Functional_characterization_Fig_5/目录下):
- 格式:.csv
- 示例文件:
- Hepatotoxicity_viability_results.csv:CSV格式,肝细胞毒性及活力检测结果
- tcell_fn_data.csv:CSV格式,T细胞功能检测数据
适用场景
- 细胞工程研究:分析机器引导下不同类型诱导细胞的分化效率与功能特性
- 流式细胞术数据分析:探索转录因子库筛选对细胞群体组成的影响
- 细胞功能机制研究:研究诱导肝细胞、星形胶质细胞及T细胞的功能调控机制
- 再生医学应用:为细胞治疗相关的诱导细胞功能优化提供数据支持