数据集概述
本数据集围绕寄生虫Geomydoecus aurei的殖民扩张展开，通过12个微卫星标记分析1935个样本的遗传数据，探究其25年间地理扩张的遗传后果，包括空间扩张模式、遗传恢复时间及等位基因冲浪现象，为物种分布变化的遗传研究提供支持。
文件详解
该数据集包含19个文件，覆盖遗传数据、分析报告及辅助文档，具体如下：
- 微卫星标记数据文件：
- Msat data for 64 infrapopulations 60 in Molecular Ecology paper + 4 from primer note.xlsx：Excel格式，含64个种群的微卫星数据
- 34 louse infrapopulationsGenePop.gen、34 gophers GenePop.gen、39 gophers GenePop.gen：GenePop格式，寄生虫及宿主的遗传数据文件
- LaJoyaOnlyGenePop.txt：TXT格式，特定区域的GenePop数据
- 基因序列数据文件：
- 39 gophers COI.fasta、39 gophers Bfib.fasta、39 gophers IRBP.fasta、39 gophers Rag1.fasta：FASTA格式，宿主的COI、Bfib等基因序列数据
- 种群结构数据文件：
- 34 2016 gophers 4 genes 3 pops.structure.txt、39 2016 gophers 4 genes 3 pops.structure.txt：TXT格式，种群结构分析数据
- 等位基因频率数据文件：
- Allele freq Geomydoecus 12 loci 64 infrapop Allele freq no headers.txt：TXT格式，12个位点的等位基因频率数据
- 样本与分析结果文件：
- Specimens table with localities final analyses.xlsx：Excel格式，含样本采集地的标本信息表
- diveRsity output_Allelic Richness_HO_HE_for_64_infrapopulations.xlsx：Excel格式，等位基因丰富度及杂合度分析结果
- 报告与脚本文件：
- PopGenReport for all 2016 lice.pdf、PopGenReport for 2016 lice south of San Acacia.pdf、PopGenReport for 2016 LaJoya lice only.pdf：PDF格式，种群遗传分析报告
- R scripts for DRYAD.docx：DOCX格式，用于数据分析的R脚本文档
适用场景
- 进化生物学研究：分析物种扩张过程中的遗传瓶颈与恢复机制
- 种群遗传学分析：探究等位基因冲浪对种群遗传结构的影响
- 气候变化生态响应研究：预测物种分布变化的遗传后果
- 濒危物种保护：为保护策略制定提供遗传多样性动态参考
- 寄生虫-宿主协同进化研究：解析寄生虫扩张对宿主种群的遗传影响
