数据集概述
本数据集围绕阿拉斯加三刺鱼宿主与裂头绦虫寄生虫的种群遗传结构展开,包含宿主线粒体细胞色素b基因测序、微卫星位点等位基因变异数据,以及寄生虫微卫星位点等位基因变异数据,用于分析地理、时间及宿主遗传变异对寄生虫种群遗传结构的影响。
文件详解
- 文档文件(.txt格式)
- 文件名称:README_for_G.aculeatus_msats_mtDNA.txt、README_for_G.aculeatus_mtDNA.txt、README_for_S.solidus_msats.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别对应宿主微卫星与线粒体DNA数据、宿主线粒体DNA数据、寄生虫微卫星数据的说明文档,解释数据采集、处理及字段定义
- 数据文件(.xlsx格式)
- 文件名称:G.aculeatus_msats_mtDNA.xlsx、S.solidus_msats.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:宿主文件包含三刺鱼个体编号、线粒体细胞色素b基因测序数据及微卫星位点等位基因数据;寄生虫文件包含裂头绦虫个体编号(关联宿主鱼编号)及微卫星位点等位基因数据
- 其他文件(.nex格式)
- 文件名称:G.aculeatus_mtDNA.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:三刺鱼线粒体细胞色素b基因测序数据的系统发育分析格式文件
数据来源
论文“Geographic and host-mediated population genetic structure in a cestode parasite of the three-spined stickleback”
适用场景
- 宿主-寄生虫相互作用研究: 分析地理、时间及宿主遗传变异对寄生虫种群遗传结构的影响机制
- 种群遗传学分析: 利用微卫星位点及线粒体基因数据,开展宿主与寄生虫的种群遗传多样性及结构研究
- 进化生物学研究: 探究宿主与寄生虫的协同进化关系,以及寄生虫宿主范围的进化适应
- 生态流行病学研究: 分析寄生虫种群结构与宿主分布、环境因素的关联,为疾病传播机制研究提供数据支持