数据集概述
本数据集基于棘胸蛙全基因组重测序数据，围绕性别相关分子标记的开发与验证展开，包含原始数据信息、质量控制结果、染色体水平SNP/InDel数量统计、样本变异可视化及基因注释等多维度数据，为两栖动物性别决定机制研究提供支撑。
文件详解
- 原始数据与质控文件：
- All_raw_data_infor.xls：XLS格式，记录原始测序数据基本信息
- All_QC_data_infor.xls：XLS格式，包含测序数据质量控制结果
- 变异位点统计文件：
- All_chrom_SNP_number.xls：XLS格式，各染色体SNP数量统计
- All_chrom_InDel_number.xls：XLS格式，各染色体InDel数量统计
- All_INDEL_number_count.xls：XLS格式，InDel数量统计汇总
- 可视化结果文件：
- ALL_sample_snp.pdf：PDF格式，样本SNP分布可视化
- ALL_sample_indel.pdf：PDF格式，样本InDel分布可视化
- sex.GLM.sex.MLM.sex.FarmCPU.SNP-Density.pdf：PDF格式，性别相关SNP密度分析结果
- 注释与说明文件：
- all_snp_indel.effect_coding_gene_annotation.xls：XLS格式，SNP/InDel位点的基因注释信息
- statement.txt：TXT格式，说明原始测序数据较大，需联系作者获取
适用场景
- 两栖动物性别决定机制研究：分析棘胸蛙性别相关分子标记特征
- 基因组变异分析：探究SNP/InDel在染色体水平的分布规律
- 分子标记开发应用：为性别鉴定、辅助育种等提供数据基础
- 基因功能注释研究：解析变异位点对基因功能的潜在影响
