数据集概述
本数据集来自珊瑚耐热性跨纬度基因组决定因素研究,包含珊瑚幼虫热胁迫存活数据、成体与幼虫转录组计数数据、转录组注释文件及连锁图谱数据,共5个文件。数据支持分析珊瑚耐热性的遗传基础,为珊瑚种群遗传拯救策略提供依据。
文件详解
- 转录组计数文件(dixon15_tagSeq_larvalCounts.txt、dixon15_tagSeq_adultCounts.txt)
- 文件格式:TXT
- 字段映射:包含样本ID(如AB1、AB2)、转录本ID(如isogroup0)及对应表达计数
- 转录组注释文件(Amillepora_transcriptome_annotations_dixon2015.zip)
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包内包含鹿角杯形珊瑚转录组注释数据
- 幼虫热存活数据(dixon15_larvalHeatSurvival.csv)
- 文件格式:CSV
- 字段映射:dam(母本ID)、dam.site(母本位点)、sire(父本ID)、family(家系)、sire.site(父本位点)、rep(重复)、well(孔位)、time(时间)、count(存活数)
- 连锁图谱数据(Amillepora_linkageMapData_dixon2015.txt)
- 文件格式:TXT
- 内容说明:包含鹿角杯形珊瑚连锁图谱相关数据
数据来源
论文“Genomic determinants of coral heat tolerance across latitudes”
适用场景
- 珊瑚耐热性遗传机制研究:分析跨纬度珊瑚耐热性的基因组基础与转录组差异
- 海洋生态保护策略制定:为珊瑚种群遗传拯救、耐热基因型交换策略提供数据支持
- 转录组数据分析:利用注释文件与表达计数开展珊瑚基因功能注释与差异表达研究
- 数量遗传学研究:通过幼虫存活数据与连锁图谱解析耐热性状的遗传力与QTL定位