数据集概述
本数据集来自传粉者群落物种丰富度对多种宿主物种中多种病毒流行率影响的研究,包含4种传粉者物种(意大利蜜蜂、凤仙花熊蜂、淡脉隧蜂属、粉足尤氏蜂)、3种RNA病毒(残翅病毒、黑蜂王细胞病毒、囊状幼虫病毒)的流行率调查数据,以及传粉者群落丰富度、丰度等群落特征数据,支持分析群落物种丰富度对病毒流行率的稀释效应,共含9个文件。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:Disease_Pos_global_publish.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含样本编号、样带ID、个体ID、年份、站点、访问次数、经纬度、采集方式、日期、传粉者类型、物种、属、性别、RNA浓度、病毒类型、病毒名称、群落物种丰富度等字段
- 文件名称:VirusPrevbySpp+Site.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:按传粉者物种和站点统计的病毒流行率数据
- 文件名称:PollinatorComm2015_2016_publish.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:2015-2016年传粉者群落组成、丰富度、丰度数据
- 文件名称:NegStdDWV_publish.csv、NegStdSBV_publish.csv、NegStdBQCV_publish.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:分别为残翅病毒、囊状幼虫病毒、黑蜂王细胞病毒的阴性标准品检测数据,包含样本编号、年份、站点、物种代码、病毒检测结果等字段
- 文件名称:SpeciesCodes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:传粉者物种代码与中文名/学名的映射表
- 代码文件
- 文件名称:PollinatorComm_and_Disease_Analysis.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于生成研究论文分析结果和图表的R代码,调用所有数据集
- 文档文件
- 文件名称:README_for_Fearon&Tibbetts_Ecology.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据来源、作者信息、文件说明等元数据
数据来源
密歇根大学Michelle L. Fearon团队,论文“Pollinator community species richness dilutes prevalence of multiple viruses within multiple host species”(Ecology期刊,2021年)
适用场景
- 生态流行病学研究:分析传粉者群落物种丰富度对病毒流行率的稀释效应
- 传粉者健康监测:评估不同传粉者物种(如意大利蜜蜂、熊蜂)的病毒感染风险差异
- 生物多样性保护:为传粉者群落多样性保护策略提供病毒传播风险的科学依据
- 病毒跨宿主传播研究:探究多种RNA病毒在不同传粉者宿主间的传播模式
- 群落生态学分析:验证群落物种丰富度与病原体流行率的关联性规律