数据集概述
该数据集提供了基于MIBI-TOF技术的存档人体组织高维成像数据,包含单通道成像文件、细胞分割结果及配套数据表,为组织成像分析与细胞表型研究提供结构化数据支持。
文件详解
- SingleChannelMIBI.zip: 压缩文件,包含按Slide[Number]Stain[Number]Point[Number][TMACoreIndex]命名的文件夹,每个文件夹内为对应组织微阵列核心的单通道TIFF标记图像。
- SegmentationOutput.zip: 压缩文件,包含经Mesmer工具处理的细胞分割结果,命名规则与单通道图像一致,用于勾勒图像中的单个细胞边界。
- DataTables.zip: 压缩文件,包含运行分析脚本所需数据表,具体为:
- ionpath_processed_data.csv:MIBI-TOF数据
- calibration_data.csv:MIBI-TOF校准数据
- ihc_data.csv:免疫组化数据
- tissue_data.csv:样本组织类型映射表
- cell_table_size_normalized_clusters.csv:含细胞簇信息的Mesmer细胞表输出
适用场景
- 组织成像技术研究:验证MIBI-TOF在存档人体组织成像中的可重复性与高维分析能力
- 细胞表型分析:结合分割结果与标记数据开展细胞类型识别及空间分布研究
- 生物医学数据建模:利用配套数据表进行成像数据与免疫组化数据的关联分析
- 计算病理学应用:开发或优化基于高维成像的病理诊断辅助算法