基于人类遗传证据预测药物副作用的遗传优先级评分开发数据集

数据集概述

本数据集是围绕“利用人类遗传证据开发遗传优先级评分以预测药物副作用”研究的数据集合,包含药物-基因关联、严重副作用子集、严重程度评分、基因数据集及功能证据等多类处理后的数据文件,支持研究结果复现。

文件详解

该数据集包含一个ZIP格式压缩包,内部文件说明如下: - 药物-基因数据集(药物-基因-父项层级): - Opentargets_dataset_se.mi_withgeneticsfiltered_5_All_parentterm_drugse_final.txt.gz:文本压缩文件,OpenTargets平台处理后的药物-基因-父项数据集 - Onsides_dataset_se.mi_withgeneticsfiltered_5_All_parentterm_drugse_final.txt.gz:文本压缩文件,Onsides平台处理后的药物-基因-父项数据集 - 严重药物副作用子集: - Withdrawndrugs_dataset_Opentargets_outcome_senomi_phase4.txt:文本文件,OpenTargets平台撤回药物副作用数据集 - Opentargets_dataset_drugwarnings_filtered_5_All_drugse_final.txt:文本文件,OpenTargets平台药物警告数据集 - Withdrawndrugs_dataset_Onsides_outcome_senomi_phase4.txt:文本文件,Onsides平台撤回药物副作用数据集 - Onsides_dataset_drugwarnings_filtered_5_All_drugse_final.txt:文本文件,Onsides平台药物警告数据集 - 严重程度评分文件: - Adr_severity_scores_phecodeX.txt:文本文件,药物不良反应严重程度评分数据 - PhecodeX信息文件: - phecodeX_info.csv:CSV文件,PhecodeX编码信息数据 - 全基因数据集(19422个蛋白编码基因与502个phecode): - Allgenes_dataset_parentterm_predictors_collapsed_sideeffect_project.txt.gz:文本压缩文件,父项层级全基因预测因子数据集 - Allgenes_dataset_phenotype_predictors_stringentfilters_sideeffect_project.txt.gz:文本压缩文件,表型层级严格过滤的全基因预测因子数据集 - 功能证据文件(LOF与GOF): - Predictors_with_direction_effect_sideeffect_project_gof_predvalue.txt:文本文件,功能获得(GOF)证据预测因子数据 - Predictors_with_direction_effect_sideeffect_project_lof_predvalue.txt:文本文件,功能缺失(LOF)证据预测因子数据 - 带方向证据的药物-基因数据集: - Opentargetsgeneticdataset_filtered_5_All_DOE_matchmechanism.txt.gz:文本压缩文件,OpenTargets平台带方向证据的药物-基因数据集 - Onsidesgeneticdataset_filtered_5_All_DOE_matchmechanism.txt.gz:文本压缩文件,Onsides平台带方向证据的药物-基因数据集

数据来源

Zenodo

适用场景

  • 药物副作用预测模型开发:基于遗传证据构建药物副作用预测模型
  • 药物安全性研究:分析药物-基因关联与严重副作用的关系
  • 遗传优先级评分验证:验证遗传优先级评分在药物副作用预测中的有效性
  • 药物研发风险评估:为药物研发阶段的副作用风险评估提供数据支持
  • 药物监管决策:辅助药物监管机构的药物安全性评价与决策
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 201.16 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。