数据集概述
本数据集包含美国俄勒冈州西部和华盛顿州地区，与瑞士松针锈病致病菌Nothophaeocryptopus gaeumannii种群结构及病害严重程度相关的环境变量数据，涵盖2014-2016年的站点环境、致病菌种群遗传及数据分析脚本三类文件，用于研究气候对该致病菌分布、丰度及病害严重程度的影响。
文件详解
- 文件名称：Bennett_SNC_Severity_and_Environmental_Data_OR_WA_2014-2016.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含站点（Site）、纬度（Lat）、经度（Long）、冬季温度（TmWinter）、夏季温度（TmSummer）、平均露点温度（MADT）、降水量（PPT）、Lineage 2相对丰度（PL2）、 foliage retention（AFR）、定殖指数（CI）、海拔（ELEV）、内陆距离（DIST）、位置（Location）等字段。
- 文件名称：Bennett_Nothophaeocryptopus_SSR_PopGen_Data_2014-2016.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Nothophaeocryptopus gaeumannii的SSR种群遗传数据，用于分析致病菌的种群结构特征。
- 文件名称：Bennett_Ecology_and_Evolution_RScript_For_Analyses.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：对应论文Bennett and Stone (2019)的数据分析R脚本，用于复现环境变量与致病菌种群结构、病害严重程度的关联分析过程。
数据来源
论文“Environmental variables associated with Nothophaeocryptopus gaeumannii population structure and Swiss needle cast severity in Western Oregon and Washington”
适用场景
- 植物病理学研究: 分析Nothophaeocryptopus gaeumannii种群结构与瑞士松针锈病严重程度的关联。
- 环境因子分析: 探究冬季温度、夏季温度、露点温度等环境变量对致病菌丰度及病害的影响。
- 种群遗传学分析: 基于SSR数据研究致病菌两个谱系的环境适应性差异。
- 病害预测模型构建: 利用环境变量与病害严重程度的关联数据，开发瑞士松针锈病预测模型。
- 数据分析复现: 通过R脚本复现论文中环境因子与致病菌种群结构、病害严重程度的统计分析过程。
