数据集概述
本数据集聚焦红带鳟鱼(Oncorhynchus mykiss gairdneri)的进化热适应研究,包含沙漠与山地溪流种群的心脏功能表型数据及基因组单核苷酸多态性(SNP)信息,揭示不同气候环境下种群的适应性分化特征,为气候变化下的生物多样性保护提供科学依据。
文件详解
- 文件名称:outlier_only_6pop.genepop
- 文件格式:.genepop
- 字段映射介绍:包含6个种群中受自然选择的候选 outliers SNPs 数据,用于分析种群间的适应性分化。
- 文件名称:genotypes.hapmap
- 文件格式:.hapmap
- 字段映射介绍:涵盖全基因组526,301个 SNPs 的基因型数据,支持群体遗传学分析。
- 文件名称:cardiac phenotype.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 字段映射介绍:记录个体鱼的心脏功能表型数据,包括最大心率、心率限制温度等关键指标。
- 文件名称:neutral_only_6pop.genepop
- 文件格式:.genepop
- 字段映射介绍:包含6个种群中中性进化的 SNPs 数据,作为适应性分析的对照。
数据来源
论文“Physiological and genomic signatures of evolutionary thermal adaptation in redband trout from extreme climates”
适用场景
- 进化生物学研究:分析红带鳟鱼不同种群的热适应进化机制,探究气候环境对物种分化的影响。
- 保护遗传学应用:识别热适应相关的功能基因位点,为气候变化下的生物多样性保护策略提供支撑。
- 生理生态学分析:研究心脏功能表型与环境温度的关联,揭示 ectotherms 对极端气候的适应性响应。
- 基因组学研究:利用 SNPs 数据开展群体结构、基因流及选择信号分析,解析适应性进化的遗传基础。