基于Transformer的酶分类模型与数据集

数据集概述

本数据集包含用于酶分类和EC功能预测的训练好的ESM2 Transformer模型及整理后的数据集,可支持酿酒酵母未知功能基因的酶功能预测,包括判断是否为酶及确定EC编号,为生物信息学领域的酶功能研究提供模型与数据支持。

文件详解

  • 文件名称: gene_dataset.tar.gz
  • 文件格式: GZ压缩包(.tar.gz)
  • 内容说明: 整理后的基因数据集压缩文件,为酶分类任务提供基础数据
  • 文件名称: esn2_model_predict_egene_ec1.pth
  • 文件格式: PyTorch模型文件(.pth)
  • 内容说明: 用于预测酶EC编号的ESM2 Transformer模型文件
  • 文件名称: esm2_model_classification_is_enzyme.pth
  • 文件格式: PyTorch模型文件(.pth)
  • 内容说明: 用于二分类判断是否为酶的ESM2 Transformer模型文件
  • 文件名称: Overview_Transformer_Based_Enzyme_Classification.pdf
  • 文件格式: PDF文档(.pdf)
  • 内容说明: 基于Transformer的酶分类项目概述文档
  • 文件名称: Overview_Transformer_Based_Enzyme_Classification.png
  • 文件格式: PNG图片(.png)
  • 内容说明: 基于Transformer的酶分类项目概述图片

适用场景

  • 生物信息学研究: 预测酿酒酵母未知功能基因的酶功能
  • 酶分类模型开发: 基于ESM2 Transformer模型进行酶分类算法优化
  • 酶功能预测应用: 辅助确定未知基因的EC编号及酶属性
  • 机器学习在生物学中的应用研究: 探索Transformer模型在生物序列分类任务中的性能
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 386.09 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。