数据集概述
本数据集来自Microbiome Datahub数据库,包含214,427个宏基因组组装基因组(MAGs)的相关数据,涵盖MAGs的元数据、Bac2Feature表型预测结果及基于MBGD同源基因组成推断的KEGG模块组成矩阵,共4个文件,为微生物组基因组研究提供结构化数据支持。
文件详解
- ModuleListName.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含KEGG模块标签列表,如M00001对应糖酵解(Embden-Meyerhof途径)等代谢通路信息
- MicrobiomeDatahub_MAGData_20250827.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:汇总MAGs的元数据信息
- MicrobiomeDatahub_MAGBac2Feature_20250827.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含MAGs的Bac2Feature表型预测结果数据
- MicrobiomeDatahubMAGModuleComposition.tsv.gz
- 文件格式:TSV.GZ
- 字段映射介绍:基于MBGD同源基因组成推断的MAGs KEGG模块组成矩阵
数据来源
Microbiome Datahub数据库(https://mdatahub.org)
适用场景
- 微生物组基因组特征分析:利用MAG元数据研究微生物基因组的基本特征与分布规律
- 微生物表型预测研究:基于Bac2Feature结果分析MAGs的表型关联信息
- 代谢通路组成分析:通过KEGG模块组成矩阵探究微生物组的代谢功能潜力
- 微生物组数据库补充研究:为微生物组相关数据库的构建与完善提供结构化数据支持