数据集概述
本数据集为大西洋海荨麻(Chrysaora quinquecirrha)在新泽西州Barnegat Bay的饮食评估数据,采用下一代测序(NGS)方法分析其肠道和触手内容物,补充传统视觉识别方法,识别出23种猎物分类群,助力理解其对食物网的影响及管理策略。
文件详解
- Excel表格文件(.xlsx,共4个)
- 文件名称:Table S2 Gastric Pouch.Tentacle Pick Build Summary.xlsx、Table S1 Gastric Lavage Build Summary.xlsx、Table S4 MEGAN assignments.xlsx、Table S3 Combined Gastric Lavage Build + Gastric Pouch.Tentacle Pick Summary.xlsx
- 内容说明:包含胃囊/触手样本构建摘要、胃灌洗构建摘要、MEGAN分类分配结果、胃灌洗与胃囊/触手组合分析摘要等数据。
- 压缩文件(.zip,共4个)
- 文件名称:Combined Gastric Lavage Build + Gastric Pouch.Tentacle Pick Contig Blast Hits.xml.zip、Combined Gastric Lavage Build + Gastric Pouch.Tentacle Pick Contigs.fa.zip、Gastric Pouch.Tentacle Pick Contigs.fa.zip、Gastric Lavage Contigs.fa.zip
- 内容说明:包含Blast比对结果XML文件、胃灌洗与胃囊/触手组合的Contigs序列文件、胃囊/触手单独的Contigs序列文件、胃灌洗单独的Contigs序列文件。
数据来源
论文“Diet assessment of the Atlantic Sea Nettle Chrysaora quinquecirrha in Barnegat Bay, New Jersey, using next-generation sequencing”
适用场景
- 海洋生态系统食物网分析: 用于研究大西洋海荨麻的捕食习性及其对Barnegat Bay生态系统结构的影响。
- 水母猎物识别技术验证: 评估NGS技术在识别胶质动物猎物(尤其是软体生物)中的有效性。
- 入侵物种生态影响研究: 分析大西洋海荨麻数量增加对中大西洋河口区域海洋生物和人类活动的潜在危害。
- 海洋生物DNA条形码应用: 探索NGS shotgun方法在海洋生物食性分析中的应用前景,为传统形态学鉴定提供补充。