数据集概述
本数据集支持北美沙漠羚羊松鼠（Ammospermophilus属）的系统发育地理分化研究，包含多基因座数据和CO3基因序列数据，以及对应的说明文档。数据用于推断系统发育关系、估算分化时间、分析分布变化及种群动态，共包含4个文件，涵盖DNA序列矩阵及研究方法说明。
文件详解
- 说明文档类
- 文件名称：README_for_AmmoCO3_CR.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：AmmoCO3_CR.txt文件的说明文档，包含CO3基因序列数据的背景、采样信息及分析方法。
- 文件名称：README_for_Ammo_multilocus.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：Ammo_multilocus.TXT文件的说明文档，包含多基因座数据的实验设计、数据处理流程及分析参数。
- 序列数据类
- 文件名称：AmmoCO3_CR.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：NEXUS格式的DNA序列矩阵，包含88个分类单元（ntax=88）、1194个字符（nchar=1194），数据类型为DNA，缺失值用“-”表示，采用交错格式，包含CO3基因691bp序列数据。
- 文件名称：Ammo_multilocus.TXT
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：多基因座DNA序列数据文件，具体内容未完全展示，推测包含羚羊松鼠多个基因的序列矩阵，用于系统发育分析。
数据来源
论文“Phylogeographic diversification of antelope squirrels (Ammospermophilus) across North American deserts”
适用场景
- 系统发育关系推断: 利用多基因座和CO3基因序列数据，构建羚羊松鼠属的系统发育树，解析物种间进化关系。
- 生物地理历史研究: 结合分化时间估算结果，分析北美沙漠羚羊松鼠的地理分化过程与地质历史事件的关联。
- 种群动态分析: 通过种群参数估算，探究末次盛冰期以来羚羊松鼠种群对气候变化的响应（如扩张或收缩）。
- 物种分布模型验证: 利用分布变化分析数据，验证物种分布模型在沙漠啮齿动物中的适用性。
- 进化生物学教学: 作为系统发育地理研究的案例数据，用于生物地理学、进化生物学课程的实践教学。
