数据集概述
本数据集包含62例18岁以下儿童ETV6::RUNX1融合阳性急性淋巴细胞白血病患者的靶向测序CNVkit分析结果，属于相关研究的第三组数据（set3）。数据支持《ETV6::RUNX1白血病治疗反应的基因组决定因素》研究，涵盖肿瘤样本纯度、倍性信息及数据处理说明，总计64个文件。
文件详解
- 核心分析文件（.cns格式）
- 文件名称：共62个，命名格式为[样本编号].tumor.merged.cns（如10532.tumor.merged.cns）
- 文件格式：.cns
- 字段映射介绍：靶向测序数据的CNVkit分析结果文件，包含肿瘤样本的拷贝数变异信息
- 肿瘤样本信息文件
- 文件名称：Tumor_purity_ploidy.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录62例肿瘤样本的纯度和倍性信息
- 数据处理说明文件
- 文件名称：README CNVkit output processing.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明CNVkit输出数据的处理方法，以及该数据集与研究中另外两组数据（set1、set2）的关联
数据来源
Zenodo（DOI:10.5281/zenodo.15174016），关联论文《Genomic determinants of therapy response in ETV6::RUNX1 leukemia》
适用场景
- 儿童白血病基因组研究：分析ETV6::RUNX1融合阳性急性淋巴细胞白血病的拷贝数变异特征
- 肿瘤治疗反应机制研究：结合CNV数据探索儿童白血病治疗反应的基因组决定因素
- 肿瘤样本特征分析：利用纯度和倍性数据研究肿瘤样本的分子特征
- 靶向测序数据分析方法验证：参考CNVkit数据处理流程，优化儿童白血病靶向测序的分析策略
