基于子树剪枝重接距离的超级树数据集

数据集概述

本数据集围绕基于子树剪枝重接(SPR)距离的超级树构建方法展开,包含相关研究的模拟参数、图表及实验数据,用于分析SPR超级树在处理基因水平转移(LGT)等进化冲突时的表现,支持进化生物学与系统发育学研究。

文件详解

  • 图表文件(PDF格式):
  • suppfigure1.pdf、suppfigure2.pdf、suppfigure3.pdf、suppfigure4.pdf:共4个PDF文件,推测为研究的补充图表,用于展示实验结果或方法流程。
  • 参数文件(TXT格式):
  • EvolSimParams.txt:TXT格式文件,包含模拟实验参数,如迭代次数(numIterations)、输出间隔(outInterval)等配置信息。
  • 压缩数据文件(ZIP格式):
  • Eukaryotic_Supertrees.zip:可能包含真核生物超级树相关数据的压缩包。
  • Bacterial_trees_and_supertrees.zip:可能包含细菌树及超级树相关数据的压缩包。

适用场景

  • 进化生物学研究:分析基因水平转移对物种进化树构建的影响,验证SPR超级树方法的有效性。
  • 系统发育学方法评估:对比SPR距离与其他优化准则(如简约性、Robinson-Foulds距离)在超级树构建中的表现。
  • 微生物学研究:通过细菌基因组数据的超级树,推断细菌类群间的基因转移路径。
  • 计算生物学模拟:利用参数文件复现进化模拟实验,优化系统发育分析算法。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.52 MiB
最后更新 2025年12月4日
创建于 2025年12月4日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。