数据集概述
本数据集为基因组数据地理渐变分析误差率研究的原始数据,包含基于正向时间个体模拟的不同进化场景(年龄、漂变、迁移、选择类型)下的误差率结果,涉及假阳性比例、模拟参数及实验数据等内容,可用于验证地理渐变分析的稳健性,共含五十份文件。
文件详解
- Excel文件(.xlsx,48个)
- 文件名称:遵循
False_proportion_*或FP_proportion_*模式(如False_proportion_500_1_gen_100_BDMI_all.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含不同模拟参数(种群大小N、迁移率m、进化代数age、选择类型selection)下的假阳性比例(FPR)、假阴性比例(FNR)等误差率统计数据
- CSV文件(.csv,2个)
- 文件名称:
Jofre_and_Rosenthal_data.csv、README.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:
Jofre_and_Rosenthal_data.csv含所有模拟杂交区重复实验结果,包含Simulation(模拟编号)、replicate(重复编号)、N(种群大小)、selection(选择类型)、age(进化代数)、m(迁移率)、FPR(假阳性率)等字段;README.csv为数据说明文档,含数据归属及字段解释
数据来源
论文“Jofre, G.I. and Rosenthal, G.G. (2021), A narrow window for geographic cline analysis using genomic data: effects of age, drift, and migration on error rates. Mol Ecol Resour”
适用场景
- 进化生物学研究:分析地理渐变分析在不同进化场景下的误差率及稳健性
- 基因组数据方法验证:评估基于基因组数据的地理渐变分析工具的可靠性
- 杂交区进化模拟:支持不同种群大小、迁移率、进化代数下的杂交区模拟实验结果分析
- 选择与漂变效应研究:探究漂变、迁移对选择信号检测误差的影响机制