数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了JT603品系gpb-2(sa603)I基因突变体的行为实验数据。实验于2009年7月10日开展,通过tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的行为,包含特征数据、wcon格式数据及原始追踪数据,共3个文件,用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2009_07_10__12_15_24__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的6690个分割骨架相关特征,用于行为分析
- wcon格式数据文件
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2009_07_10__12_15_24__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,遵循线虫行为数据交换标准格式
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2009_07_10__12_15_24__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含帧率(25.5102帧/秒)、视频像素分辨率(4.57251微米/像素)等基础参数及追踪过程数据
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 基因功能研究:分析gpb-2(sa603)I基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为学分析:基于线虫行为特征数据,探究神经调控或基因表达与行为表型的关联
- 行为追踪技术验证:验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为数据采集与特征提取中的应用效果
- 实验方法复现:参考实验方案(如30分钟适应期、OP50食物条件)复现或优化线虫行为实验
- 数据标准化研究:基于wcon格式数据,探索模式生物行为数据的标准化存储与交换规范