抗体亲和力预测用中和数据与ENV序列比对数据集

数据集概述

该数据集包含用于预测抗体亲和力的中和数据(IC50值)及HIV ENV基因序列比对数据,适配人工神经网络模型。中和数据样本源自相关研究,ENV序列来自HIV序列数据库,共4907条序列,比对长度为1369。

文件详解

  • 文件名称: Neutralization_data_-_sample.csv
  • 文件格式: CSV
  • 字段映射: 包含不同病毒株(如0260.v5.c36)对多种抗体(如2F5、VRC01)的中和数据(IC50值)
  • 文件名称: HIV1_ALL_2013_env_PRO_E.fasta
  • 文件格式: FASTA
  • 内容说明: 从HIV序列数据库下载的HIV ENV基因序列比对文件,含4907条序列,比对长度为1369

数据来源

  • 中和数据样本: 源自J. Huang等人2012年发表于Nature的研究
  • ENV序列: HIV Sequence Database(www.hiv.lanl.gov/content/sequence/HIV/mainpage.html)

适用场景

  • 生物信息学研究: 用于构建基于人工神经网络的抗体亲和力预测模型
  • 病毒学分析: 探究HIV ENV序列变异与抗体中和活性的关联
  • 免疫学研究: 分析不同抗体对HIV病毒株的中和效能差异
  • 药物研发: 辅助HIV中和抗体的筛选与优化研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.11 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。