KEGG通路气泡图信息数据集

数据集概述

该数据集包含KEGG通路相关的气泡图信息数据,记录了不同通路中蛋白质的位置、氨基酸、KO编号、T/C比值及调控类型等核心信息,为分析通路中蛋白质的表达调控情况提供基础数据支持。

文件详解

  • 文件名称:all_map_info.txt
  • 文件格式:TXT(.txt)
  • 字段映射:
  • KEGG pathway:KEGG通路名称(如map00051 Fructose and mannose metabolism)
  • Protein accession:蛋白质登录号(如P05064)
  • Position:氨基酸位置(如108)
  • Amino acid:氨基酸种类(如K)
  • KEGG KO No.:KEGG同源基因编号(如K01623)
  • T/C Ratio:T/C比值(如2.7678964705471727)
  • Regulated Type:调控类型(如Up)

适用场景

  • 生物信息学分析:研究KEGG通路中蛋白质的表达调控模式
  • 代谢通路研究:分析特定通路(如果糖和甘露糖代谢)的分子机制
  • 基因功能注释:结合KO编号注释蛋白质的生物学功能
  • 差异表达分析:基于T/C比值筛选通路中的关键调控蛋白质
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.01 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
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