数据集概述
本数据集为小鼠骨骼肌可逆神经损伤的空间转录组数据，是论文“Spatially resolved transcriptomics reveals innervation-responsive functional clusters in skeletal muscle”的配套数据。包含生成论文图表的代码及处理整合后的原始数据集，共六个文件，用于研究骨骼肌中神经支配响应的功能集群。
文件详解
- 空间数据集文件
- 文件名称：Spatial Dataset.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含处理和整合后的原始空间转录组数据集，具体字段需解压后查看原始数据结构
- 预处理与注释代码文件
- 文件名称：Supplementary_FIle_2_Petrany Dataset Preprocess and Annotation.Rmd
- 文件格式：Rmd
- 字段映射介绍：Petrany数据集预处理与注释的代码文件
- 预处理与注释代码文件
- 文件名称：Supplementary_FIle_1_Chemello Dataset Preprocess and Annotation.Rmd
- 文件格式：Rmd
- 字段映射介绍：Chemello数据集预处理与注释的代码文件
- 预处理与注释代码文件
- 文件名称：Supplementary_FIle_3_Lin Dataset Preprocess and Annotation.Rmd
- 文件格式：Rmd
- 字段映射介绍：Lin数据集预处理与注释的代码文件
- 预处理整合注释代码文件
- 文件名称：Supplementary_FIle_4_ST Dataset Preprocess_Integration_Annotation.Rmd
- 文件格式：Rmd
- 字段映射介绍：ST数据集预处理、整合与注释的代码文件
- 图表生成代码文件
- 文件名称：Supplementary_FIle_5_Figures.Rmd
- 文件格式：Rmd
- 字段映射介绍：生成论文图表的代码文件
数据来源
论文“Spatially resolved transcriptomics reveals innervation-responsive functional clusters in skeletal muscle”
适用场景
- 骨骼肌神经损伤机制研究：分析空间转录组数据中神经支配响应的功能集群，探究损伤修复过程中的分子机制
- 空间转录组数据分析方法验证：利用预处理、整合及注释代码，验证空间转录组数据处理流程的有效性
- 骨骼肌功能集群空间分布研究：通过空间转录组数据，研究骨骼肌不同功能集群的空间分布特征
- 神经-肌肉相互作用研究：结合空间转录组数据，分析神经支配对骨骼肌功能的调控作用
