数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)KS99品系egl-27(ok151)II基因突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为特征,包含视频及处理后的行为特征数据,可用于分析该基因突变对蠕虫运动行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:egl-27 (ok151)II on food R_2010_07_23__15_34_56412_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含26534个分割骨架的特征信息
- 原始实验数据文件
- 文件名称:egl-27 (ok151)II on food R_2010_07_23__15_34_56412.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基础参数(如帧率29.9401帧/秒、视频像素对应微米数4.59377等)及原始行为记录数据
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:egl-27 (ok151)II on food R_2010_07_23__15_34_56412.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,遵循wcon格式标准
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析egl-27(ok151)II基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 行为表型分析: 基于提取的26534个分割骨架特征,研究基因突变体的行为模式差异
- 神经生物学实验: 结合基因背景与行为数据,探索相关基因在神经调控中的作用
- 生物信息学算法验证: 作为tierpsy等行为分析软件的测试数据集,验证特征提取算法的准确性
- 模式生物实验复现: 为其他线虫行为研究提供标准化实验设计参考(如30分钟适应期、OP50食物条件)