快速折叠肽的蒙特卡洛模拟数据集

数据集概述

该数据集包含快速折叠肽的蒙特卡洛模拟实验数据,核心围绕十氨基酸与二十氨基酸肽链从变性构象到平衡构象的折叠过程展开,采用联合原子力场及隐式水模型,通过多种模拟移动方式确定肽链最低能量结构。

文件详解

该数据集包含多个类型的文件,具体说明如下: - 核心模拟数据文件: - 无扩展名文件(149个):可能为模拟过程中的中间输出或参数配置文件 - .pdb格式文件(144个):如box_01_step_00000000000140.pdb,记录不同模拟步骤下的肽链结构数据 - 图像文件: - .jpeg格式文件(6个):如cageframe1000.jpeg,展示模拟过程中的肽链构象图像 - 文档与配置文件: - Metropolis Monte Carlo Simulations of Fast-Folding Peptides.pdf及Lab2_MMC_Fast_Folding_Peptides.pdf:实验说明文档 - license.gpl:授权协议文件 - .m4、.am、.in等格式文件:编译配置相关文件 - 其他辅助文件: - all.xlsx:汇总数据表格 - cage correct.zip:压缩包文件 - animatepdbs.tcl:Tcl脚本文件,可能用于PDB文件动画演示

适用场景

  • 生物物理学研究:分析肽链折叠过程中的构象变化规律
  • 结构生物学研究:探究肽链最低能量构象的形成机制
  • 计算生物学研究:验证蒙特卡洛模拟方法在肽链折叠研究中的应用效果
  • 分子动力学教学:作为教学案例展示肽链折叠模拟的实验设计与数据分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.58 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
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