数据集概述
本数据集包含两种蝰蛇(Bothrops asper和Bothrops jararaca)毒腺转录组中低丰度蛋白的计算建模相关补充材料,涵盖特定蛋白的序列、模型、结构注释及模型验证数据,为研究蝰蛇毒腺蛋白的结构与功能提供支持。
文件详解
该数据集由三个压缩文件组成,对应三类补充材料,具体说明如下:
- Supplementary Material 1.zip:包含六种蛋白的序列、模型及Pfam注释文件
- File S1_AG5:Bothrops asper和Bothrops jararaca的Allergen 5相关数据
- File S2_Apolipophorin:Bothrops asper和Bothrops jararaca的Apolipophorin与von Willebrand Factor相关数据
- File S3_ARSB:Bothrops asper和Bothrops jararaca的Arylsulfatase相关数据
- File S4_Botrocetin:Bothrops asper和Bothrops jararaca的Botrocetin相关数据
- File S5_DHODH:Bothrops asper和Bothrops jararaca的Dihydroorotate dehydrogenase相关数据
- File S6_basparin:Bothrops asper的Basparin与Bothropasin相关数据
- Supplementary Material 2.zip:包含六种蛋白的模型验证文件(采用ERRAT、RAMACHANDRAN、Verify3D方法)
- File S7_Ag5:Allergen 5的模型验证数据
- File S8_Apolipophorin:Apolipophorin与von Willebrand Factor的模型验证数据
- File S9_ARSB:Arylsulfatase的模型验证数据
- File S10_Botrocetin:Botrocetin的模型验证数据
- File S11_DHODH:Dihydroorotate dehydrogenase的模型验证数据
- File S12_Basparin:Basparin与Bothropasin的模型验证数据
- Supplementary Material 3.zip:包含两种蝰蛇的TPM丰度分析表格
- Table S1:Bothrops asper的TPM丰度分析数据
- Table S2:Bothrops jararaca的TPM丰度分析数据
适用场景
- 生物信息学研究:用于蝰蛇毒腺转录组中低丰度蛋白的序列与结构分析
- 蛋白质组学研究:支持两种蝰蛇毒腺蛋白的丰度特征及功能机制探究
- 计算生物学应用:可用于蛋白结构模型的验证方法对比与优化研究
- 蛇毒相关医学研究:为蛇毒蛋白的潜在药用价值挖掘提供数据基础