数据集概述
本数据集为针对受风力涡轮机致死影响的两种非模式蝙蝠(红蝙蝠Lasiurus borealis和灰蝙蝠L. cinereus)开发的全基因组微卫星标记数据,包含测序分析得到的微卫星位点、引物序列及相关实验验证结果,支持蝙蝠种群遗传多样性与结构研究。
文件详解
- 说明文件(README)
- 文件名称:README_for_Keller_etal_2013MER_MSATCOMMANDER_primers.txt、README_for_Keller_etal_2013MER_MSATCOMMANDER_microsats.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含引物序列、微卫星位点的关联属性及数据相关说明,关联论文《Genome-wide microsatellite marker development...》的研究背景与方法。
- 数据文件(Excel)
- 文件名称:Keller_etal_2013MER_MSATCOMMANDER_primers.xlsx、Keller_etal_2013MER_MSATCOMMANDER_microsats.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:涵盖筛选出的微卫星位点信息、跨物种引物序列及多态性验证结果,包括42个高多态性位点的扩增与分型数据。
- 脚本文件(Shell)
- 文件名称:Keller_etal_MER2013_Lasiurus_pipeline.sh
- 文件格式:SH
- 字段映射介绍:用于处理Lasiurus属蝙蝠基因组测序数据的生物信息学分析流程脚本,支持微卫星标记开发的流程复现。
数据来源
论文“Genome-wide microsatellite marker development from next-generation sequencing of two non-model bat species impacted by wind turbine mortality: Lasiurus borealis and L. cinereus (Vespertilionidae)”
适用场景
- 蝙蝠种群遗传学研究:分析Lasiurus属蝙蝠的种群遗传多样性、结构及基因流,评估风力涡轮机对种群的影响。
- 微卫星标记应用:利用开发的42个高多态性位点进行跨物种种群遗传分析,支持非模式蝙蝠物种的遗传研究。
- 基因组资源补充:为蝙蝠基因组数据库提供微卫星标记资源,完善非模式物种的遗传工具。
- 生物信息学流程复现:通过Shell脚本复现微卫星标记开发流程,辅助相关基因组学研究方法的优化。