数据集概述
本数据集包含穴居蜉蝣(蜉蝣目)的系统发育基因组学研究数据,涉及7个穴居蜉蝣科的19个内群类群和4个外群类群的遗传数据,包括核糖体DNA基因、蛋白质编码位点及参考序列等,用于分析系统发育关系及下颌 tusks 的进化。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含引用信息、数据文件清单及各文件内容概述
- Mayfly_1_Probes.txt.gz
- 文件格式:GZ压缩文本
- 字段映射介绍:新型杂交富集探针组序列文件
- Miller_et_al_ST1-ST2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:补充表格文件,包含研究相关的支持性数据
- ML_Bayes_Con.nwk
- 文件格式:NWK
- 字段映射介绍:最大似然法与贝叶斯分析得到的系统发育树文件
- Miller_et_al_Alignments.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩归档
- 字段映射介绍:序列比对文件集合
- MAYFLY_ref.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩归档
- 字段映射介绍:探针设计所用的各基因座参考序列文件夹
- Miller_et_al_SF1.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充文件1,包含研究相关的详细说明文档
- Miller_et_al_Loci.tar.gz
- 文件格式:GZ压缩归档
- 字段映射介绍:蛋白质编码基因座数据文件集合
数据来源
DRYAD数据库(Miller et. al 2018研究)
适用场景
- 蜉蝣目系统发育研究:分析7个穴居蜉蝣科的系统发育关系及分类地位
- 昆虫形态进化分析:研究下颌 tusks 在穴居蜉蝣中的起源与丢失机制
- 基因组探针设计参考:基于Mayfly_1_Probes文件开发昆虫类群的杂交富集探针
- 系统发育方法验证:比较最大似然法与贝叶斯分析在昆虫系统发育重建中的效果
- 蜉蝣科群分类学修订:基于分子系统发育结果修正蜉蝣目科级分类系统