数据集概述
本数据集通过RAD测序技术对湖白鲑(Coregonus clupeaformis)杂交回交家系进行遗传连锁图谱构建及QTL定位,涵盖表型、基因表达和传递率失真相关遗传标记信息,助力理解湖白鲑物种对生殖隔离的基因组结构基础。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README_for_Genotypes_Phenotypes_Expression_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据集包含的七个核心文件,包括基因型矩阵、标记图谱、表型QTL数据等,标注文件用途及格式规范
- 数据压缩包
- 文件名称:Genotypes_Phenotypes_Expression_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含3438个RAD标记的基因型矩阵(3438_mapped_loci.LOC)、标记位置图谱(3438_mapped_loci.map)、表型数量性状数据(pQTL.qua)等关键数据文件,支持直接导入MapQTL5软件分析
适用场景
- 水产遗传连锁图谱构建: 利用RAD标记基因型数据构建高密度遗传连锁图谱,解析湖白鲑基因组结构
- 表型QTL定位分析: 通过表型性状数据与遗传标记关联,定位影响湖白鲑生态适应性状的基因组区域
- 基因表达调控研究: 结合基因表达数据,分析基因表达差异的遗传基础及其对生殖隔离的贡献
- 物种生殖隔离机制研究: 基于QTL定位结果,探究湖白鲑物种对生殖隔离的分子遗传机制
- 水产育种分子标记开发: 筛选与重要经济性状关联的分子标记,应用于湖白鲑良种选育