数据集概述
本数据集为月鱼(Lampris guttatus)DNA条形码研究相关数据,包含样本信息及基因序列分析文件。通过线粒体COI、cytb基因和核Rag1基因测序,发现全球分布的月鱼存在5个分化显著的进化支,支持其为隐存物种复合体的结论,为渔业管理单元划分提供依据。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称:Sample information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含月鱼样本的基础信息,用于关联基因序列与样本来源
- 基因序列分析文件
- 文件名称:Opah COI nexus.txt、Opah cytb nexus.txt、Opah rag1 nexus.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:NEXUS格式的基因序列数据,包含分类单元(taxa)及序列信息,用于构建系统发育树
- 系统发育树文件
- 文件名称:Opah COI tree、Opah cytb tree、Opah Rag1 tree
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:基于COI、cytb、Rag1基因序列构建的系统发育树结果,反映月鱼不同进化支的亲缘关系
数据来源
论文“DNA barcoding provides support for a cryptic species complex within the globally distributed and fishery important opah (Lampris guttatus)”
适用场景
- 渔业资源分类管理:基于隐存物种复合体结论,优化月鱼渔业管理单元划分
- 物种分类研究:利用多基因序列数据,分析月鱼的物种分化与系统发育关系
- 生物多样性评估:为全球月鱼种群的生物多样性保护提供分类学依据
- 分子标记开发:基于COI、cytb、Rag1基因序列,开发月鱼物种鉴定的分子标记