数据集概述
本数据集包含河流生丽鱼属（Lamprologus）物种的完整线粒体基因组数据，重点关注盲丽鱼（L. lethops）。数据涵盖基因组特征文件、基因序列比对文件、分区文件及样本信息表，支持丽鱼科物种的分子生物学研究，共包含18个文件。
文件详解
- 线粒体基因组特征文件（*.gff）
- 文件名称：如Lamprologus_markerti_OQ818000.gff、Lamprologus_lethops相关gff文件等（共13个）
- 文件格式：GFF
- 字段映射介绍：General Feature Format文件，记录线粒体基因组的特征信息，文件名包含物种名称及对应登录号
- 基因序列比对文件（*.phy）
- 文件名称：lamprologus_all_genes.phy、lamprologus_coding_genes.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：分别为全基因序列比对文件、仅编码基因序列比对文件
- 分区文件（*.nex）
- 文件名称：lamprologus_all_genes_partition.nex、lamprologus_coding_genes_partition.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：对应比对文件的基因分区及密码子分区文件
- 样本信息表
- 文件名称：Table1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含物种详情、采集地点、凭证标本号等信息
数据来源
论文“Complete mitochondrial genomes of riverine Lamprologus (Actinopterygii, Cichlidae) with an emphasis on the blind cichlid L. lethops”
适用场景
- 丽鱼科物种分子系统发育研究：利用线粒体基因组数据分析物种间亲缘关系
- 盲丽鱼适应性进化研究：重点分析L. lethops线粒体基因组特征与盲态适应的关联
- 线粒体基因组结构比较：对比不同丽鱼物种线粒体基因组的结构差异
- 物种鉴定与分类：基于线粒体基因序列进行丽鱼科物种的分子鉴定
- 分子生态学研究：结合样本采集信息分析物种地理分布与遗传多样性的关系
