数据集概述
本数据集为早衰疾病分子景观多层网络探索研究的补充材料,包含补充图表、表格、文件及文本,覆盖疾病聚类、基因关联、网络参数、富集分析等内容,支持对早衰疾病分子机制的深入分析。
文件详解
- 补充图表(Supplementary Figures)
- 内容:包含3张图表,分别为itRWR算法50次、150次迭代及100次迭代(树状图 cutoff值0.5)下的早衰疾病群落聚类结果
- 补充表格(Supplementary Tables)
- 内容:包含4张表格,涉及早衰疾病HPO表型、67种早衰疾病及132个关联基因、多层生物网络4层结构的节点/边/密度统计、MultiXrank工具参数
- 补充文件(Supplementary Files)
- 内容:包含9个文件,涉及生理衰老基因富集分析结果、67个群落/6个聚类的基因节点列表、聚类对应的疾病列表、不同组织衰老差异表达基因、群落及聚类的功能注释富集分析、聚类的HPO表型富集分析
- 补充文本(Supplementary Text)
- 内容:包含1篇文本,对比itRWR与传统随机游走、多层网络划分、最短路径网络距离等替代网络探索策略
- 压缩包文件
- 文件名称:LandscapePA_SuppMat.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容:打包上述所有补充材料
数据来源
论文“The molecular landscape of premature aging diseases defined by multilayer network exploration”(Beust C.等作者)
适用场景
- 早衰疾病分子机制研究:分析疾病群落聚类、基因关联及功能注释,揭示早衰疾病的分子景观
- 多层生物网络分析:基于网络层参数及算法结果,探索生物网络结构与疾病的关联
- 基因功能富集研究:利用富集分析结果,挖掘早衰相关基因的生物学过程及通路
- 疾病表型关联分析:通过HPO表型数据,研究早衰疾病的表型特征与分子基础的联系
- 网络算法应用验证:对比不同网络探索策略在早衰疾病研究中的效果,优化分析方法