数据集概述
本数据集包含美国Lava Beds国家纪念区熔岩洞细菌垫与表层土壤细菌群落的16S rDNA序列、基于Greengenes数据库的分类分配结果及数据处理用R脚本，用于比较两者的微生物多样性差异，揭示洞穴与表层环境对细菌群落的选择作用。
文件详解
- 文件名称：lavabeds_16SrDNA_Rscript.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含三类核心内容——16S rDNA测序序列数据、通过Greengenes数据库获得的细菌分类学分配结果、用于处理上述数据的R脚本文件，支持微生物群落结构分析与多样性比较。
数据来源
论文“Comparison of Lava Cave Bacterial Mat Communities to Overlying Surface Soil Bacterial Communities from Lava Beds National Monument, USA”
适用场景
- 微生物多样性研究：分析熔岩洞细菌垫与表层土壤的细菌群落组成、OTU多样性及优势类群差异
- 环境微生物选择机制分析：探究洞穴与表层环境对细菌群落的筛选作用，揭示微生物适应特征
- 新物种资源挖掘：基于高比例未鉴定到属的序列，挖掘熔岩洞环境中的潜在新型微生物
- 微生物生态学教学与实践：作为微生物群落数据分析的案例，用于R脚本处理测序数据的教学演示
