Leiopathes_Genotypes_Based深海黑珊瑚种群遗传结构与微卫星谱系数据

数据集概述

本数据集包含深海黑珊瑚Leiopathes glaberrima的种群遗传数据,涵盖微卫星标记基因型、种群结构分析文件及生态位模型数据。数据支持研究该物种在墨西哥湾北部的遗传分化、繁殖特征及微生境分布,涉及5个采样点、2个潜在隐存谱系的遗传信息与环境因子关联分析。

文件详解

  • 基因型数据文件
  • 文件名称:Ruiz-Ramos_et_al_2014_Leiopathes_Genotypes.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含Pop(种群编号)、Sample Name(样本ID)、10个微卫星位点(BC_01等)的等位基因数据(6位数字,前三位为小等位基因,后三位为大等位基因)、Color(颜色表型)、latitude(纬度)、longitude(经度)
  • 说明文档
  • 文件名称:README_for_Ruiz-Ramos_et_al_2014_Leiopathes_Genotypes.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:解释基因型数据的字段定义、微卫星位点的等位基因编码规则及数据来源背景
  • 种群结构分析文件
  • 文件名称:Ruiz-Ramos_et_al_2014_DS_STRUCTURE.txt、Ruiz-Ramos_et_al_2014_Structure_mainparams
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含种群遗传结构分析的输入数据及参数设置,用于解析种群分化特征
  • 生态位模型数据
  • 文件名称:VK826_MaxEnt_dryad.zip、VK906_MaxEnt_dryad.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含基于最大熵模型的微生境分布分析数据,用于关联珊瑚分布与深度、坡度等环境因子

数据来源

论文“Home bodies and wanderers: sympatric lineages of the deep-sea black coral Leiopathes glaberrima”

适用场景

  • 种群遗传学研究:分析深海黑珊瑚的遗传分化、基因流模式及隐存谱系特征
  • 繁殖策略分析:探究不同谱系的近交/远交模式及无性繁殖(碎片化)特征
  • 微生境适应性研究:通过MaxEnt模型数据关联珊瑚分布与深度、坡度等环境因子
  • 海洋生物地理学应用:解析墨西哥湾北部黑珊瑚种群的地理分化及扩散机制
  • 保护生物学支撑:为深海珊瑚礁生态系统的保护优先级评估提供遗传多样性依据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 19.78 MiB
最后更新 2026年1月13日
创建于 2026年1月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。