数据集概述
本数据集聚焦Leptodactylus属蛙类的Na+K+ ATP酶α1亚基(ATP1A1)基因进化研究,包含基因序列比对、酶活性实验原始数据及说明文档,用于分析食毒蟾蜍蛙类通过基因重复获得毒素抗性的分子机制,揭示12个氨基酸替换在抗毒素功能与酶活性平衡中的作用。
文件详解
- NKA_Enzyme_Assays_Raw_Data_Readme.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、研究者信息(哥伦比亚大学Peter Andolfatto团队)、数据生成时间(2021-02-23)等元数据
- Mohammadi_ATP1A1_alignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:Leptodactylus属蛙类ATP1A1基因同源序列比对文件,记录基因重复后两个 paralog 的核苷酸序列差异
- NKA_Enzyme_Assays_Raw_Data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:Na+K+ ATP酶活性实验原始数据,包含不同氨基酸替换组合的酶功能测定结果,用于分析抗性突变的功能效应
数据来源
论文“Concerted evolution reveals co-adapted amino acid substitutions in Na+K+ ATPase of frogs that prey on toxic toads”
适用场景
- 分子进化机制研究:分析基因重复后 paralog 序列的趋同进化与分化,探讨基因转换与选择压力的平衡作用
- 毒素抗性分子机制分析:通过氨基酸替换位点研究蛙类Na+K+ ATP酶抗蟾蜍毒素的结构基础
- 酶功能进化研究:利用酶活性实验数据,探究抗性突变对酶功能的多效性及补偿机制
- 基因功能验证:支持蛋白质工程实验设计,验证特定氨基酸替换的功能效应