数据集概述
本数据集围绕伊比利亚野兔（Lepus granatensis）的历史渐渗杂交展开，包含其转录组注释序列及核基因SNP分型数据，旨在研究其向北扩张过程中与北极兔（L. timidus）的线粒体基因渐渗机制，以及核基因与线粒体基因的互作关系，为进化遗传学中中性扩散与自然选择的作用提供数据支持。
文件详解
- 文件名称：genotyped_snps.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含317个伊比利亚野兔样本的100个核基因SNP分型数据，覆盖物种分布范围，用于分析等位基因频率的地理分布特征。
- 文件名称：gra.transcriptome.annotated-or-orf.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：伊比利亚野兔的转录组注释序列文件，包含开放阅读框（ORF）信息，为基因功能分析提供基础序列数据。
- 文件名称：snps_from_RNA-seq.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：通过RNA-seq技术检测到的SNP位点数据，记录候选位点的基础信息，是SNP分型的前期数据来源。
数据来源
论文“Range expansion underlies historical introgressive hybridization in the Iberian hare”
适用场景
- 进化遗传学研究：分析伊比利亚野兔与北极兔的渐渗杂交模式及物种替代过程中的基因流动机制。
- 转录组功能注释：基于注释的转录组序列，研究野兔基因的结构与功能特征。
- 种群遗传学分析：利用SNP分型数据探究伊比利亚野兔种群的北扩历史及遗传结构变化。
- 核质互作研究：通过核基因与线粒体基因的关联分析，探索线粒体基因渐渗对核基因的潜在影响。
