数据集概述
本数据集包含来自患者源性异种移植(PDX)模型的白血病细胞与间充质基质细胞共培养的显微成像数据。细胞经活性染料(CyQuant)染色后,通过PerkinElmer Operetta高内涵显微镜成像,OME-ZARR文件中还包含Stardist生成的分割标签及scikit-image的regionprops测量结果,涵盖1个孔、2个视野及DMSO处理条件信息。
文件详解
- 文件名称:operetta_plate.zarr.zip
- 文件格式:ZIP(压缩OME-ZARR格式)
- 字段映射介绍:包含共培养细胞的显微成像数据、Stardist分割标签、scikit-image的regionprops测量结果;关联"condition"表记录扰动条件(C3孔为0.125% DMSO处理),涉及1个孔、2个视野的成像内容。
适用场景
- 白血病细胞活性分析: 利用CyQuant染色成像数据,评估PDX模型白血病细胞在共培养体系中的活性状态。
- 细胞形态学研究: 通过Stardist分割标签及regionprops测量结果,分析白血病细胞与间充质基质细胞共培养后的形态特征变化。
- 药物筛选模型验证: 基于DMSO处理组数据,建立或验证白血病PDX共培养模型的药物筛选基准。
- 高内涵显微成像数据分析: 探索OME-ZARR格式在医学细胞成像数据存储与分析中的应用。