数据集概述
本数据集为两种树懒(Bradypus和Choloepus)微生物群落研究的补充数据,包含12个表格文件。内容覆盖宏基因组测序的分类学与丰度分析、真菌 metabarcoding 结果、功能注释及碳水化合物活性酶(CAZy)家族丰度等,支持对树懒相关微生物的分类、功能及代谢特征研究。
文件详解
- Table S1
- 文件描述:基于Kaiju nr_euk数据库对组装宏基因组的分析结果
- Table S2
- 文件描述:包含两种树懒宏基因组测序数据的分类学、丰度数据的透视与交互式表格(基于Kaiju nr_euk数据库)
- Table S3
- 文件描述:基于Kaiju fungi数据库对组装宏基因组的分析结果
- Table S4
- 文件描述:针对Bradypus的Kraken数据库搜索结果
- Table S5
- 文件描述:针对Choloepus的Kraken数据库搜索结果
- Table S6
- 文件描述:ITS1真菌 metabarcoding 的丰度(读段数)与分类学数据
- Table S7
- 文件描述:ITS2真菌 metabarcoding 的丰度(读段数)与分类学数据
- Table S8
- 文件描述:Bradypus variegatus所有样本宏基因组数据的eggNOG-mapper原始结果(示例文件:Table S8_eggNOG_DNA.xlsx)
- Table S9
- 文件描述:Choloepus hoffmanni所有样本宏基因组数据的eggNOG-mapper原始结果(示例文件:Table S9_eggNOG_DNA.xlsx)
- Table S10
- 文件描述:Choloepus和Bradypus宏基因组数据的eggNOG-mapper功能注释摘要(仅包含真菌和细菌)
- Table S11
- 文件描述:run_dbcan得到的原核生物CAZy家族丰度数据(序列数SeqNum及百分比SeqNum%),CS代表C. hoffmani,BS代表B. variegatus
- Table S12
- 文件描述:run_dbcan得到的真菌CAZy家族丰度数据(序列数SeqNum及百分比SeqNum%),CS代表C. hoffmani,BS代表B. variegatus
- 通用信息
- 文件格式:XLSX(共12个文件,占比百分之百)
- 示例文件:Table S4_results_taxonomy_Kaiju&Kraken.xlsx、Table S7_ITS2_Metabarcoding_abundance.xlsx等
适用场景
- 树懒共生微生物分类学研究: 利用Kaiju、Kraken数据库分析结果,探究两种树懒体内微生物的物种组成与丰度特征
- 真菌群落多样性分析: 通过ITS1/ITS2真菌 metabarcoding 数据,研究树懒相关真菌群落的多样性与分布
- 微生物功能注释研究: 基于eggNOG-mapper结果,分析树懒微生物组的功能基因组成与代谢潜力
- 碳水化合物活性酶分析: 利用CAZy家族丰度数据,研究树懒微生物组中参与碳水化合物代谢的酶类分布与差异
- 两种树懒微生物组比较研究: 对比Bradypus和Choloepus的微生物组成、功能注释及CAZy家族丰度差异,揭示物种特异性微生物特征